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因此用于PCR反應(yīng)的塑料耗材必須避免存在污染物和抑制劑,同時(shí)又具有可保障最佳PCR效果的高質(zhì)量。
01
塑料耗材組成
材料
PCR / qPCR耗材通常由聚丙烯制成,因?yàn)樗嵌栊缘牟⑶夷軌虺惺軣嵫h(huán)過(guò)程中溫度的快速變化。聚丙烯的惰性性質(zhì)使其對(duì)于反應(yīng)物質(zhì)的吸收降低至最小,確保獲取最佳的PCR結(jié)果。為了進(jìn)一步保障在純度和生物兼容性方面的批次間一致性,應(yīng)當(dāng)在生產(chǎn)過(guò)程中使用全新未循環(huán)使用的醫(yī)學(xué)級(jí)或分子生物學(xué)級(jí)高品質(zhì)聚丙烯原料。請(qǐng)注意,某些PCR / qPCR板邊框用更強(qiáng)的聚碳酸酯框 制成,以與高通量機(jī)器人應(yīng)用兼容。
顏色
PCR管和板通??商峁┒喾N不同的顏色形式,以便于對(duì)于樣品的視覺(jué)區(qū)分和鑒別,特別是在高通量實(shí)驗(yàn)中。盡管耗材的顏色對(duì)DNA擴(kuò)增沒(méi)有影響,但在設(shè)置實(shí)時(shí)PCR或qPCR 的反應(yīng)時(shí),與透明耗材相比,我們更推薦使用白色耗材,以實(shí)現(xiàn)靈敏和準(zhǔn)確的熒光檢測(cè)。
白色耗材通過(guò)阻止熒光折射出管(圖2A)來(lái)提高qPCR數(shù)據(jù)的靈敏度和一致性。折射被最小化時(shí),更多的信號(hào)被反射回檢測(cè)器,從而增加信噪比(圖2B)。此外,白色管壁可阻止熒光信號(hào)傳遞至PCR儀模塊,避免被吸收或不一致地反射熒光信號(hào),從而使重復(fù)實(shí)驗(yàn)(圖1B)中的差異降至最低。在極少數(shù)情況下,如果熒光探測(cè)器由于白色孔的信號(hào)反射增強(qiáng)而過(guò)飽和,可以使用磨砂孔替代。
02
生產(chǎn)概況
防止灰塵和生物學(xué)污染物
為了避免可干擾DNA擴(kuò)增的污染,PCR/qPCR塑料耗材應(yīng)不含核酸酶和DNA的污染。盡管如高壓和輻射等滅菌方法可去除細(xì)菌和DNA酶,但這些方法并不能去除灰塵和DNA殘留。殘留的灰塵客戶可能會(huì)抑制PCR,而片段化的DNA依然可作為模板從而產(chǎn)生非特異性的擴(kuò)增。
因此,在生產(chǎn)這些塑料耗材時(shí),從制模到最終的包裝都必須在具有顆粒數(shù)量限制的設(shè)施環(huán)境中進(jìn)行。例如,100,000級(jí)潔凈室允許在立方英尺空氣中不超過(guò)100,000個(gè)直徑≥0.5μm的顆粒。這些類(lèi)型的設(shè)施符合國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織(如ISO 9001 )規(guī)定的嚴(yán)格指導(dǎo)原則,以防止灰塵和生物污染。
質(zhì)量保證檢驗(yàn)
為了確保質(zhì)量,生產(chǎn)商可能需要對(duì)PCR/qPCR塑料耗材進(jìn)行視覺(jué)或物理檢驗(yàn)其完整性,以確保對(duì)于反應(yīng)成分保護(hù)。可以執(zhí)行物理測(cè)試來(lái)評(píng)估樣品孔的蒸發(fā),密封和電連續(xù)性以檢查泄漏。對(duì)于生物測(cè)試,塑料耗材會(huì)進(jìn)行某些DNA目標(biāo)分子的qPCR擴(kuò)增,以評(píng)估核酸酶和人類(lèi)DNA的污染。生產(chǎn)商對(duì)于經(jīng)歷過(guò)這些嚴(yán)格檢驗(yàn)的PCR/qPCR塑料耗材可提供相應(yīng)的檢測(cè)報(bào)告書(shū)。